У меня была такая же ситуация и тоже с G.baldianum.
Высохшее растение, с похожими симптомами, обрабатывать, обрывая остатки корней с последующей подсушкой
было невозможно и превратило бы его в сухофрукт. Поэтому забросил его в ведро с водой, где он пролежал более
суток. затем, набухшее растение прошло все вышеуказанные операции(обрезка корней, обработка фундазолом в смеси с корневином, подсушка
и пересадка в более проницаемый состав земляной смеси с большим количеством "мёртвого" субстрата(кирпич, мелкий гравий).
Растение очень быстро "аклемалось" и по сей день чувствует себя нормально.
Вообще, может это моё только мнение, но растения рода Gymnocalycium при стандартном подходе с редким поливом пересушивают и отбрасывают корни,
которые не дают затем развиваться новым "сосущим" корешкам, как бы обвалакивая плотной чешуйкой оставшиеся центральные "огрызки". При последующем обильном поливе, на них начинает образовываться плесень, не давая шанса выходу новых корней.
Чтобы избавиться от этих "чешуек" после подсушки, часа за два-три перед посадкой я уже давно зачищаю их обычной старой зубной щёткой по направлению от стебля по корням, поворачивая,чтобы почистить со всех сторон. Если под "чешуёй" окажутся корни подозрительного цвета, значит после их обрезки, повторяю
процедуры сначала(обработка фундазолом в смеси с корневином,подсушка...)